旧历九月二十六日清晨，携载着三个步兵旅群的近二百余艘海船抵达京都附近的海面上做好了登陆作战的准备。
同刘洪涛、高海量等人在南九州与江户等地的登陆不同，船队并没有在四国至本岛一带的海面上遭遇前来拦截的船队，甚至没有从船上望见岸上严阵以待的大军，石垒所率领的第三步兵旅就顺利的在京都附近的海滩展开了登陆。
携载着第四旅和第五旅的船队继续沿着海岸向东前进。王新盟率领的第四旅准备在名古屋附近的平原登陆，而马冲昊率领的第五旅则准备直接增援江户一带巩固关东平原附近的占领并进而向整个本岛的中北部前进。
已及而立之年的政仁后水尾天皇在清晨刚刚醒来的时候就得到了新朝新增援而来的大军逼近海岸附近的消息。然而对这一切，政仁却没有太多的震惊和意外。不久前从江户那里就穿来了德川家在短短的时间内于自己所在的江户城附近被登陆上岸的新朝强兵打的大败的消息。远非当年的蒙元可以相提并论的强敌战力也在之后的不少作战中得到了证实，整个列岛的沦陷不过时间问题了。
如果说当年的朝鲜面临外敌入侵的时候还可以指望上国大军，而如今的列岛唯一的希望就在于强敌不至于过于霸道，至少能够保留天皇皇室地位，哪怕像以前最不利的时候那样仅仅做个更甚于当今的傀儡也好，那样列岛说不定还能保留一丝元气并有复兴的希望。
政仁天皇没有打算像江户城的德川家或是南九州的岛津家那样展开顽抗，而是在得到消息后就将早已准备好的降表由使着带领前去同上岸的新朝大军接触。
这种行为如果是在十几天前，不要说德川和子皇后，就是倾向朝廷的心腹也决然不会接受。可是在新朝大军在列岛势如破竹的当下，朝内在也没有谁对此持有意义了。
石垒率领的大军按部就班小心翼翼展开登陆的过程中几乎没有遭到任何抵抗，连远处的围观和骚扰也没有。这使得战士们越发觉得不安，似乎将要面临什么大规模的埋伏一样。只到整个大军乃至所携带的火炮与后勤物资乃至马匹全都完整的登上了岸，石垒的心才终于安了下来。
正准备向京都古城展开推进的时候，遍遇到了政仁天皇派遣的求和来使。石垒担心这可能是拖延时间的换兵之计，除了将来使直接扣押之外并不予以理财，反而加快了行军速度并以最快的速度带领部队完成了对京都城的包围。