果然随后各个山头的情报组织也先后获知日军有大量情报外泄的情况，日本人不相信自己的同胞会背叛帝国，所以将怀疑的目光瞄向了平时称兄道弟的皇协军将领以及某些“上层社会”人士。一时间日占区风声鹤唳，平时耀武扬威的大小汉奸和“特工总部”的特工们都开始夹起尾巴做人，宪兵队里开始人满为患···
国际方面，意大利巴尔博元帅(8月起由格拉齐亚尼元帅)统一指挥的2个意大利野战集团军在利比亚展开:第10集团军(司令为贝尔蒂将军)在利比亚、埃及边界，第5集团军(司令为加里波第将军)在突尼斯当面。9月13日，第10集团军以5个师、1个团级集群、6个坦克营(利比亚东部共有9个意大利师)开始进攻韦维尔将军指挥的英国尼罗河集团军(2个师另2个独立旅，在埃及共有6.6万人，168架飞机，其中包括驻巴勒斯坦飞机)。
英集团军在埃及、利比亚边界仅有1个展开的师。意军推进90公里，于9月16日进逼西迪拜拉尼，但由于指挥失灵和补给中断，不得不停止了尔后的进攻。英军则继续退后，一直到马特鲁港附近预先构筑的阵地才立住脚。敌对双方之间形成了一个宽达130公里的真空地带。
9月27日：日本参加柏林 － 罗马轴心，德、意、日法西斯三国同盟条约在柏林签订。为了配合不断升级的侵略战争，日本**极力在国内煽动战争狂热。首相近卫文组织起大政翼赞运动，而陆相东条英机则大肆鼓吹武士道精神。
10月，昭和天皇挑选杉山元接替年迈的闲院宫载仁亲王出任参谋总长，杉山元上任的第一件事就是将赵继统调回国，进入了参谋本部。按照日本1889年宪法规定，日本天皇为国家最高元首，为日本陆海军最高统帅，可以指挥全国所有军队。但实际上由于20世纪以后日本军阀势力强大，形成由军人左右国家政策方向的局面，而军方人物中最有实权的是当时被称为日本陆军“三总长”的陆军大臣、参谋总长和训练总监。
陆军大臣是日本陆军省的首脑，主管**国防政策、部队动员、国防预算、武器研制等，对有关军政问题可以与总理大臣或参谋总长并列上奏天皇，也可单独上奏天皇；参谋总长是日军参谋本部的首脑，其主要职责是辅佐天皇指挥陆军，并代表天皇下达作战命令；训练总监则控制着日本陆军各兵种的全部初、中级军校。日本陆军“三总长”的倾向常常决定着日本军方的决策方向。
实际上参谋总长和陆军大臣的地位才最为重要。而且，同样在军队的建设和指挥上，参谋总长和陆军大臣具有不分仲伯的地位，据说这是从德国陆军参谋机构搬用过来的制度。日本效仿的德意志军队的指挥大权在皇帝手中，有辅佐的幕僚为左膀右臂。
辅佐的幕僚统称为“军令”，而另一方面军队的建设和维持还有诸如征兵、培养军官、军饷支出、制服和武器以及预算等问题就叫做“军政”。如此就使得参谋总长比陆军大臣拥有更大的权限。一旦战争发生，参谋总长就超出了作为天皇军事幕僚长这一单纯的职务本分，当仁不让地介入到决定日本进程的政治中，挥舞着权力大棒打压反对意见。比如外务大臣提出收兵吧，他们就借口指挥军队的军权归属于天皇不容他人置喙，他们把此称为“统帅权独立”。