山本和南云在中途岛作战后广受指责。批评意见认为山本违反了军事作战集中兵力的基本原则，而且作战计划过于复杂。但也有意见指出盟军也实施过复杂程度不相上下的作战而且获得成功，并将失败的原因归咎于美军破译日军密码，在事先已对山本的计划洞若观火。但若山本没有驳回南云提出的在空袭前先进行侦察的的请求，便可以抵消美军破译密码并埋伏航母所获得的优势。
赵继统此次旗帜鲜明的站在了山本和南云的一方，他声称作战计划和指挥都没有问题，其根本原因是因为作战计划和密码本的泄露！说明对方已经成功的策反了我方高级将领或者尾崎秀实、中村功之流，这是帝国军人的耻辱！中途岛之战败乃是人祸非战之过！
随即在日本国内展开了一场轰轰烈烈的甄别行动，同时美国**也承认在日本高层隐藏着一位代号“白头鹰”的反法西斯斗士，并为其颁发了一枚“国会金质奖章”（美国最高的平民荣誉，受奖者可以不是美国公民。直到战后才真正颁发给赵继统。同时颁发的还有一枚杰出总统自由勋章，是为了表彰他在整个对日作战中做出的卓越贡献，使之成为第一个获得两枚美国最高的平民荣誉勋章的中国人），一时间，海军军令部内人人自危，就连赵继统这位按说接触不到密码本的陆军参谋人员都接受了审查。
中途岛战役的失败阻碍了日军的推进，但日本海军仍拥有相当实力，还有重新获得主动权的机会。他们制定了“fs作战”试图占领萨摩亚群岛和斐济以便切断澳大利亚与美国的联系，如此一来便可削弱道格拉斯·麦克阿瑟上将和他的美澳联合部队所带来的威胁。于是，山本和他的对手欧内斯特·金海军上将都将注意力转向瓜岛上的机场。陆军方面6月份南方军在席卷东南亚后，对盟军的反攻放松了警惕，认为主要由日本海军兵力就可以对付。
为此确定，南方军采取守势，除配备确保安全和用于外围作战的兵力外，抽出余部转用于中国大陆，并同时与国内部队的改编，复员等革新军容措施相结合，以保证战略上的机动性。预想抽调的主要兵力有:近卫、第2、第4、第5师团回日本;第33、第38师团、第3飞行集团一部到中国关内;第48师团复归台湾;第66师团等部去中国满洲。
这一抽调计划后来由于赵继统的阻止，没有完全实施。实际调出的仅第4师团、第3飞行集团和若干军直属部队(主要是技术兵种，大部分返回关东军)而已。日本军队经过过甲午战争和日俄战争，而从这两场战争中日本人很莫名其妙地把战争和战斗给混淆了起来，认为只要取得一次关键战斗的胜利，整个战争就算胜利了，这就是日本陆军和海军共有的决战概念。
从太平洋战争开始以后，日本人就一直在寻找这种决战的机会，这次大家都确认了这个瓜岛就是日美决战的舞台，日本只要赢得了瓜岛，美国鬼畜就必须低下头来乖乖和大日本帝国谈判。陆军出身的东条英机不满赵继统总是让陆军成为海军的附属，老是配合他们作战，将赵继统一顿臭骂，结果两个人从作战室里出来之后，又好得跟一个人似得了。