不但岳飞受詔回鄂州，朝廷还命杨沂中回镇江，淮西军回池州，刘錡回太平州。宋撤军后，淮寧、蔡、郑又被金兵占领。绍兴十一年初，金兀朮再次南下，攻占寿春、庐州，但宋将邵隆、王德、关师古等连战皆捷，杨沂中在拓皋也取得了胜利。
这时秦檜忽然下令杨沂中和张俊立即撤兵，韩世忠听说之后屯驻濠州不敢前进；刘錡也放弃寿春而回，从此不再出兵。
四月，给侍中范同献计给秦檜，想办法尽收诸将兵权。秦檜密奏高宗，召见三大将论功行赏，韩世忠、张俊同为枢密使，岳飞为副使，令宣抚司军隶属枢密院。
六月，朝廷拜秦檜为左僕射、同中书门下平章事兼枢密使，进封庆国公。不久又被升为少保，加封冀国公，权倾朝野。他坚持主张与金人议和，继续前一年双方协议的程序。正好金兀朮也有意求和，秦檜便上奏朝廷派刘光远、曹勛使金，又以魏良臣为通问使前往金国。
秦檜在绍兴九年怂恿高宗罢了岳飞的军权，原来想趁岳飞成为一介平民的机会派杀手去刺杀他；想不到高宗也不太相信金国，所以给岳飞的名义只是放他一次长假，若有需要随时可以召他回来重掌兵权，所以准许张宪与王贵派兵保护他。
何况岳飞本身武艺十分高强，若贸然派人刺杀，万一失败恐怕反而引祸上身；正在犹豫的时候，金兀朮突然毁约攻宋，岳飞也復职进行第四次北伐。
后来高宗将颁发班师詔给岳飞的工作全权交给秦檜，让他觉得这又是一个陷害岳飞的良机；于是故意快速连发十二道金牌，而且语气出奇的强硬，希望激怒岳飞再度抗命，自己便有机会致他于死地想不到这次岳飞居然隐忍不发，遵照旨意马上班师回朝，使自己的期待又一次落空。
幸好高宗还有韦贤妃这个软肋，秦檜去覲见高宗说：「金人还是很有诚意履行之前的协议，送回太上皇的灵柩与太后；微臣愿意再度与他们重啟谈判，议定新的条件，务必完成皇上的心愿。」
高宗说：「朕有你这样忠心的大臣，真是朕与母后的福气；一切就委託爱卿全权与他们谈判，不管甚么条件，只要不太离谱都可以答应，务必成全朕的孝心。」
于是秦檜先后派遣两批人前往金国谈判新的议和条件，还特别让他的亲信带了一封密函给金兀朮说：「关于诛杀岳飞，永久解除四太子心腹之患，时机已经完全成熟；四太子只需要再和议条件坚持南宋必须诛杀岳飞，并将首级函送金国，我在我朝保证一定完成此事。」
不久，魏良臣与金使萧毅等人商议，双方以淮水为界，让宋割唐、邓二州，秦檜即派何铸报聘答应金的条件。
接着谈到之前金国同意，归还宋徽宗灵柩以及高宗生母韦太后之事，金兀朮想到宋朝居然有岳飞这样的英雄人物，硬是把他踩在脚下，因此只要岳飞在世一天，他就寝食难安；所以几天以来一直想把杀岳飞列为必备条件，又觉得南宋皇帝绝对不可能答应。想不到秦檜在密函里提到的竟然就是这件他梦寐以求的事情，而且说他有把握让此事成真，看来当初自己真是独具慧眼，选择了秦檜这个能力超强的大汉奸。
所以金兀朮马上让金使提出一个条件说：「你们宋朝在和议中答应再多条件，割让多少土地都没用，因为你们只要随后派来岳飞大军又抢回去，我们又没人挡得住他。所以你们一定要先杀死岳飞，把首级送来，我们才愿意跟你们和谈。」
金兀朮使出这招撒手鐧，高宗只好叫韩诚去请岳飞，一起召开紧急会议商量对应之策。
韩诚先带岳飞到他府第后进一间密室，岳飞发现室内有两人正在泡茶间聊；韩诚叫他二人抬起头来，岳飞一看大吃一惊，两人的容貌儼然就是赵构与自己。
「自从经歷苗、刘之祸，皇上便令我在全国搜寻终于找到这两人。」韩诚说：「这两人在我这里吃好住好，只是不能外出。他们一个担任皇上的替身，随时准备为皇上牺牲；另一个若有需要可以扮做你，希望能借助你的威名镇摄意图不轨的人，不敢轻举妄动，让皇上有较充裕的时间逃跑。」
接着他便带岳飞进宫面圣。
高宗首先说，关于大方向的和战今天已经不再讨论。