吴有性学医几十年，读了很多医书，诊治过很多病例。他发现，有些病不是六淫之邪所致，而是四时不正之气所为，他一直不明白得病的原理，而在医药班，竟然听到细菌致病之说，觉得正好可以解释他遇到的这些病例，所以才有来请教皇帝之事。如今皇帝准许他去解剖人体，自然不会推辞。
他作了一揖道：“学生谢过陛下厚恩，学生一定不会辜负陛下的期望。”
朱由校道：“国内不允许解剖人的尸体，所以朕只能把主意打到建奴身上。蛮夷与我大明人的区别是在精神，肉体并无不同。朕会给你们一个钦差令牌，近卫军各个部队都会全力支持你的。”
吴有性接过魏忠贤递过来的钦差令牌后，跪倒谢过皇帝。朱由校这次没有阻拦，只是说道：“早点动身，等到显微镜研制完善后，朕会派人给你们送过去的。”
第二个进来的学生却不是农学班的，而是一个十三四岁的少年。他作了一揖道：“陛下，器械班学生方以智申请到兵器局去实习。”
朱由校打量着这个少年：十多岁的少年努力装出老成的样子，只作揖显然是听了外面的人说的，而面对着皇帝，终究不能镇定自如，腿微微地抖着。
今年研究院的器械班新生并没有直接进入兵器局实习，因为朱由校认为还是先学一些基础知识了再去后更好一些，而且已经有了去年的学生，对研究院学生的需要并没有那么迫切。
朱由校笑笑道：“你为什么要直接去实习？应该学习的功课你都学好了？”
微微颤抖的双腿渐渐有不支之势，方以智满头大汗地说道：“陛下，学生，学生已经学了课本上的知识，觉得只有和实际相对照，才能真正学到知识。”
朱由校有些奇怪，于是问道：“你在哪里学的？”
方以智回道：“陛下，学生在家里由母亲和姑姑教了一些西方的学识，在这里有些东西学生已经学过了。”
朱由校问道：“你是哪里人？”
方以智道：“陛下，学生是安庆府桐城县人，家父现任兵部职方司郎中。”
原来如此，朱由校点了点头道：“兵器局有许多研究方向，有蒸汽机车，有火铳，有大炮，还有其它的一些研究，那你想去哪里实习？”
方以智想了想说：“火铳大炮，杀人之器，不学也罢，我去学习制造蒸汽机车。”
朱由校大笑道：“小小年纪，倒有些老气横秋的样子，有意思。杀人之器也有其可用之处，象建奴猖獗，如果没有火铳大炮，如何能够杀退他们。朕准你去兵器局实习，希望你能帮助兵器局，造出更好更快的蒸汽机车。”
第三批学生更奇怪，竟然是地理科的两个学生。一个三十多岁，一个二十多岁。两人作揖后，二十多岁的学生开口道：“陛下，学生张岱想要退学。”
朱由校奇道：“你想退学，为什么？别人想进研究院都进不了呢，你竟然想退学？”
张岱道：“学生当时来考，本来想治史的，但是没有历史班，想着历史地理相近，所以报的地理班，但后来才发现，其实学生对地理不感兴趣，既然没有历史，学生觉得还是回家写文治史比较合适。”