山本抵达后乘坐交通艇的艇长是到司令部当面接受的命令，和陆军方面的沟通通过电话转达，大家都在拉包尔，没有泄密的可能性。其次调查4月13日那封通报行程的详细电报（机密第一三一七五五号电），发报的通信队在4月1日刚刚换了乱数，从理论上说也不可能被破译。
这里简单讲一讲为啥不可能被破译。众所周知，电报代码使用数字代替具体文字，什么内容对应什么数字文件叫做密码表。比如我＝3107，要＝6298，吃鸡等于5720。的那么传递“我要吃鸡”发报的内容就是310762985720。不过一套密码表长期使用，只要有一套丢失，密码就毫无机密可言。敌人也可以根据高频词汇和密码与事件的对应进行破解，况且一旦使用面积广，更换密码本的成本会相当之高。
想要进一步保密得弄一个乱数表，乱数表是个本子，上面有0001到9999的数字随机排列。然后制作配套手册，手册上365条，写明每一天用第几页的数字，是加还是减。比如今天应该用第5页，加。第五页的数字是3266，然后用这个数字的每一位加密码表数字的每一位，只取个位数。3+3=6，1+2=3，0+6=6，7+6=13取3，“我”字的代码就成了6363，依次类推，加密后的我要吃鸡＝636394548986。
消息传递到队友那里，他们根据乱数表和配套手册，反向解读密码。整个环节的关键是乱数表配套手册，只要把每本手册进行编号，缩小持有人范围，人册一一对应，定期确认每册在每人手里，信息就可以安心传达，一旦发现配套手册遗失后更换手册的成本远低于更换密码表。这只是一个小小的例子，军用密码密级更高，甚至有二次甚至多次加密，密码和乱数也会增大到5位数甚至更多位，所以日本海军的自信不是凭空而来的。
言归正传，东南方面舰队进行调查的同时还搞了一次钓鱼执法，用同样的方式发报说东南舰队司令长官按照啥啥路线几点几分到哪，真安排了轰炸机飞对应航线和几架战斗机护航。美军获得赵继统的通知后，深知一个高层的情报人员原比东南舰队司令长官有用的多，没有实施拦截。相反，在击杀山本后，美军持续派遣少量飞机在布干维尔等岛屿进行低空侦察和扫射隐蔽事情真相。
日本航空专家也从给山本护航飞行员的纪录中进行分析，当时美机数量较少且高度只有1500米，与之前之后的低空侦察和扫射攻击方式匹配。综合中央和地方的种种调查报告最终得出结论，山本遇袭阵亡是一个偶发事件···也就是意外？？？
1943年5月12日，美军在阿图岛登陆，古贺峰一必需在5月17日率领武藏号返回东京，原定的公开时间恐怕要提前。“山本坠机善后工作领导小组”开始了公开流程。
山本坠机第三十一天（5月19日），海兵32期首席毕业，山本的好友堀悌吉将山本的死讯以私人方式通知山本家属，次日海军省人事局长上门正式通知。
山本坠机第三十三天（5月21日），下午三点，海军省对日本海军记者俱乐部会员进行了通知，两小时后进行了本期最开头的大本营发表。晚些时候，日本天皇追赠山本五十六元帅头衔，与山本一同遇难的其他成员也分别获得了追晋。5月21日下午三点，日本帝国大本营发表了一段简短的通讯，大意是：联合舰队司令长官海军大将山本五十六，于本年四月在前线执行全般作战指导中与敌交战，在飞机上壮烈战死，后任由古贺峰一递补，已在执行联合舰队之指挥。